En av de største utfordringene et prosjektstyringssystem kan finne er behovet for å tilpasse seg ulike krav til hvert prosjekt med minimal innsats. For å løse dette er det viktig å ha en god standardisert strømning og en standardisert kontroll som er uavhengig av prosjekttype, men samtidig fleksibel nok til å inkorporere særpregene til hvert prosjekt, slik at lokal ledelse kan tilpasses Data utganger som ønsket.